Die Moskauer Staatliche Lomonossov-Universität ist die größte und wichtigste Universität Russlands. Mit der Ruhr-Universität Bochum (RUB) und der Universität Duisburg-Essen (UDE) verbindet die Lomonossov-Universität eine Reihe von Kooperationen im Bereich der Forschung und Lehre. Seit 2017 gibt es eine universitätsübergreifende Kooperationsvereinbarung zwischen der Ruhr-Universität Bochum und der Moskauer Staatlichen Universität. In jedem Semester stellt die Ruhr-Universität Bochum drei Rektoratsstipendien für Ausstauschstudierende aus der Lomonossov-Universität zur Verfügung, für Bochumer Ausstauschstudierende stehen wiederum kostenfreie Wohnheimplätze an der Partneruniversität in Moskau zur Verfügung. Die Zusammenarbeit erstreckt sich an der RUB auf die Bereiche Physik, Osteuropäische Geschichte und Psychologie. An der UDE sind insbesondere die Bereiche der Biologie/Geografie, Chemie und Physik beteiligt.

Die Nationale Forschungsuniversität Higher School of Economics (HSE) zählt zu den führenden russischen Hochschulen im Bereich der Sozialwissenschaften. Neben dem Campus in Moskau unterhält die Hochschule Filialen in St. Petersburg, Nischnij Nowgorod und Perm.
Die HSE entstand ursprünglich auf Initiative führender liberaler Wirtschaftswissenschaftler. Der Großteil der 16.000 Studierenden verteilt sich auf die Fächer Wirtschaft, Sozialwissenschaften, Mathematik und Informatik, in denen die HSE die besten Nachwuchswissenschaftler/-innen Russlands ausbildet. Die Universität ist Teil der „5Top100″-Initiative und gilt als eine der international aktivsten Hochschulen Russlands. Mit der Higher School of Economics verbindet vor allem die Ruhr-Universität Bochum eine ganze Reihe an Kooperationen im Bereich Literaturwissenschaften, Slawistik und Philosophie. Im Jahr 2019 soll nun auch ein universitätsübergreifendes Memorandum of Understanding von den beiden Hochschulen unterzeichnet werden.

Die Kasaner Föderale Universität (KFU) ist die zweitälteste Universität Russlands und hat ihren Sitz in Kasan, der Hauptstadt der Republik Tatarstan. Heute ist die Kasaner Universität ein sich dynamisch entwickelndes und international anerkanntes Zentrum der akademischen Exzellenz und mit 190 Kooperationsabkommen mit Partnern aus 53 Ländern ein aktiver Teilnehmer der internationalen Zusammenarbeit. Die KFU kooperiert bereits seit einigen Jahren mit der Ruhr-Universität Bochum, insbesondere in den Geowissenschaften und der Physik. Seit einiger Zeit weitete sich die Kooperation zwischen der RUB und der KFU auf den geisteswissenschaftlichen Bereich aus – beide Hochschulen sind Partner im Projekt „Internationale digitale Netzwerkuniversität“. Seit 2017 verbindet die beiden Universitäten ein übergreifendes Kooperationsabkommen.

Die Staatliche Universität Sankt Petersburg ist ein starker Partner der Technischen Universität Dortmund, im Zentrum der Kooperation zwischen den Hochschulen steht dabei erfolgreiche Forschungsarbeit im Bereich der Physik. Seit 2015 verbindet die Universitäten ein von der DFG und der RFBR finanzierter Sonderforschungsbereich (SFB). Prof. Bayer (TU Dortmund) ist Sprecher des ersten deutsch-russischen SFB (TRR 160) „Kohärente Manipulation wechselwirkender Spinanregungen in maßgeschneiderten Halbleitern“. Derzeit sind in die Projekte des Verbunds rund 150 Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler involviert, die aus der Technischen Universität Dortmund, der Ruhr-Universität Bochum, der Universität Paderborn, sowie auf russischer Seite – aus der SPBU und dem berühmten Joffe-Institut der Russischen Akademie der Wissenschaft kommen. Der Forschungsverbund adressiert mit der Erforschung der Manipulation von Spinanregungen in Halbleitern eines der aktuell wichtigsten Themen in der Festkörperphysik.